Одгледувањето со колба со тресење е различно од површинското одгледување каде што клетките се директно изложени на високи концентрации на кислород. Во културите со колба со тресење, клетките се изложени на ниски концентрации на кислород бидејќи микроорганизмите се суспендирани во супата од културата.